Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TrmuQ9DAT5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TrmuQ9DAT5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms