Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
3110070M22RikQ9DAQ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms