Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccdc89Q9DA73 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc89Q9DA73 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms