Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Samd8Q9DA37 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Samd8Q9DA37 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms