Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp12Q9D9M2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp12Q9D9M2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms