Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Speer4bQ9D9F7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Speer4bQ9D9F7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms