Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SlirpQ9D8T7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms