Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fip1l1Q9D824 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms