Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc39Q9D5Y1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc39Q9D5Y1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms