Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PudpQ9D5U5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms