Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lpcat2bQ9D5U0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms