Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms