Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Zcchc13Q9D548 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Zcchc13Q9D548 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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