Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ribc2Q9D4Q1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms