Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Phf6Q9D4J7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms