Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J3

Dcbld1, Discoidin, CUB and LCCL domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcbld1Q9D4J3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dcbld1Q9D4J3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dcbld1Q9D4J3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms