Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D3

4933402D24Rik, MCG113882, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402D24RikQ9D4D3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4933402D24RikQ9D4D3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms