Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp2bpQ9D4C6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lrp2bpQ9D4C6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrp2bpQ9D4C6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrp2bpQ9D4C6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrp2bpQ9D4C6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrp2bpQ9D4C6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lrp2bpQ9D4C6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lrp2bpQ9D4C6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms