Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmntd1Q9D4C1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmntd1Q9D4C1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms