Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Syce1Q9D495 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms