Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rsph14Q9D3W1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms