Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
5430402E10RikQ9D3N5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms