Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D3J9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D3J9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D3J9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms