Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rufy3Q9D394 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rufy3Q9D394 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms