Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf128Q9D304 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rnf128Q9D304 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms