Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx20Q9D2Y5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx20Q9D2Y5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Snx20Q9D2Y5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snx20Q9D2Y5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx20Q9D2Y5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx20Q9D2Y5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms