Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MceeQ9D1I5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MceeQ9D1I5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms