Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mrpl53Q9D1H8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms