Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exosc7Q9D0M0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms