Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab3bQ9CZT8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms