Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmss1Q9CZT6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmss1Q9CZT6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms