Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
3110001I22RikQ9CZ70 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
3110001I22RikQ9CZ70 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms