Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snx7Q9CY18 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms