Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Kdm8Q9CXT6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Kdm8Q9CXT6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms