Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Sgo1Q9CXH7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sgo1Q9CXH7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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