Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmed5Q9CXE7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms