Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ddx28Q9CWT6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ddx28Q9CWT6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms