Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pfdn1Q9CWM4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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