Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MINDY3Q9CV28 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms