Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Smurf1Q9CUN6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Smurf1Q9CUN6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms