Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
4930535I16RikQ9CUI2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms