Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkiras2Q9CR56 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkiras2Q9CR56 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms