Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL4

Mrpl20, 39S ribosomal protein L20, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl20Q9CQL4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Mrpl20Q9CQL4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl20Q9CQL4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mrpl20Q9CQL4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms