Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snrpb2Q9CQI7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snrpb2Q9CQI7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms