Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pdzk1ip1Q9CQH0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pdzk1ip1Q9CQH0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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