Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQF4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQF4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms