Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NepnQ9CQ76 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms