Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkp2Q9CQ73 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms