Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Commd4Q9CQ02 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms