Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt88Q9CPR6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krt88Q9CPR6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms